Virological characteristics of cases of COVID-19 in northern Viet Nam, January–May 2020
Notice bibliographique
Résumé
Background: Viet Nam confirmed its first case of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection on 23 January 2020 among travellers from Wuhan, China, and experienced several clusters of community transmission until September. Viet Nam implemented an aggressive testing, isolation, contact tracing and quarantine strategy in response to all laboratory-confirmed cases. We report the results of SARS-CoV-2 testing during the first half of 2020 in northern Viet Nam. Methods: Between January and May 2020, 15 650 upper respiratory tract specimens were collected from 14 470 suspected cases and contacts in northern Viet Nam. All were tested for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR. Individuals with positive specimens were tested every three days until two tests were negative. Positive specimens from 81 individuals were cultured. Results: Among 14 470 tested individuals, 158 (1.1%) cases of SARS-CoV-2 infection were confirmed; 89 were imported and 69 were associated with community transmission. Most patients (122, 77%) had negative results after two tests, while 11 and 4 still tested positive when sampled a third and fourth time, respectively. SARS-CoV-2 was isolated from 29 of 81 specimens (36%) with a cycle threshold (Ct) value < 30. Seven patients who tested positive again after testing negative had Ct values > 30 and negative cultures. Conclusion: Early, widespread testing for SARS-CoV-2 in northern Viet Nam identified very few cases, which, when combined with other aggressive strategies, may have dramatically contained the epidemic. We observed rapid viral clearance and very few positive results after clearance. Large-scale molecular diagnostic testing is a critical part of early detection and containment of COVID-19 in Viet Nam and will remain necessary until vaccination is widely implemented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».