MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4213389452 · doi:10.1093/jcag/gwab049.198

A199 UTILIZATION OF MUCUS-DERIVED O-GLYCAN SUGARS BY THE PATHOGEN <i>C. RODENTIUM</i> FACILITATE ITS COLONIZATION OF THE MURINE GUT

2022· article· en· W4213389452 sur OpenAlexaff
M Mslati, Hongbing Yu, Chenhui Ma, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitrobacter rodentiumMicrobiologyBiologyMucinPathogenMucusSialic acidVirulenceGlycanHuman pathogenBacteriaBiochemistryGlycoproteinEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The ability of enteric pathogens to colonize and expand within the mammalian gastrointestinal (GI) tract is determined by several factors, including the ability to find and acquire nutrients. The thick mucus layer that lines the inner surface of the large intestine is rich in sugars that can serve as nutrient sources for several members of the microbiota. Whether these sugars can also be used by invading bacterial pathogens to colonize the GI tract is still unclear, in particular for the family of attaching and effacing (A/E) bacterial pathogens, including the human diarrheal pathogens EHEC and EPEC. Aims To investigate the ability of the murine A/E pathogen Citrobacter rodentium to use mucin-derived sugars as a nutrient source, and the importance of these sugars in the virulence of C. rodentium during in-vivo infection. Methods To identify which sugar(s) are required for C. rodentium to colonize and grow in the murine GI tract, we generated mutants lacking single or multiple genes involved in the uptake and catabolism of mucin-derived O-glycan sugars. This was followed by in-vitro growth assays in minimal media supplemented with mucin sugars to investigate the growth properties of C. rodentium and the generated mutants on mucin sugars. Results We determined that C. rodentium was able to use three mucin O-glycan sugars: sialic acid, galactose, and N-acetylglucosamine (GlcNAc) as both carbon and nitrogen sources for in-vitro growth. C. rodentium exhibited the maximal growth rate and density on GlcNAc, followed by sialic acid, and finally galactose. A mutant C. rodentium strain carrying a deletion in the nagA gene was unable to grow on both GlcNAc and sialic acid, confirming that the breakdown pathways for these two sugars merge and are processed by shared suite of enzymes. As for galactose, combined deletions in the genes mglB and galP were required to abolish growth on this sugar. Notably, a mutant strain carrying simultaneous deletions in nagA, mglB, and galP was unable to grow on all three mucin sugars, as well as on purified mucin. Conclusions Our results demonstrate that intestinal mucin sugars serve as potential nutrient sources for C. rodentium and that C. rodentium can catabolize three of these sugars. Future work will examine whether these sugar pathways contribute to C. rodentium colonization of the murine GI tract. Funding Agencies CCC, CIHRCH.I.L.D. Fdn

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology→Même sujetProbiotics and Fermented Foods→Travaux en français237 207→