Temperate phage-antibiotic synergy across antibiotic classes reveals new mechanism for preventing lysogeny
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A recent demonstration of potent synergy between a temperate phage and the antibiotic ciprofloxacin suggested a scalable approach to exploiting temperate phages in therapy, termed temperate phage-antibiotic synergy (tPAS), which specifically interacted with the lysis-lysogeny decision. To determine whether this would hold true more broadly across antibiotics, we challenged Escherichia coli K12 with the well-studied model λ-like phage HK97 and a set of 13 antibiotics spanning seven classes. As expected, given the conserved induction pathway targeted, we observed synergy with classes of drugs known to induce an SOS response; a sulfa drug, other quinolones, Mitomycin C, and some β-lactams. Curiously, we observed an equally potent synergy with antibiotics not known to induce the SOS response: protein synthesis inhibitors gentamicin, kanamycin, tetracycline, and azithromycin. The synergy results in an 8-fold reduction in the effective MIC of gentamicin, complete eradication of the bacteria, and, when deliberately administered at sub-optimal doses, drastically decreases the frequency of lysogens emerging from the combined challenge – more so even than was previously described for ciprofloxacin. However, unlike ciprofloxacin, lysogens exhibit no increased sensitivity to the antibiotic, synergy was maintained in the absence of RecA, and, when quantified over time, the antibiotic reduced the initial frequency of lysogeny rather than result in selection against formed lysogens. Not only do our results confirm that SOS-inducing antibiotics broadly result in temperate-phage specific synergy, but we other antibiotics can interact with temperate phages specifically and result in potent synergy. This is the first report of a means of chemically blocking entry into lysogeny, providing a new means for manipulating the key lysis-lysogeny decision point in temperate phages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».