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Enregistrement W4213450731 · doi:10.3389/fpls.2022.817251

ROOT HAIR DEFECTIVE3 Is a Receptor for Selective Autophagy of the Endoplasmic Reticulum in Arabidopsis

2022· article· en· W4213450731 sur OpenAlexafffund
Jiaqi Sun, Weina Wang, Huanquan Zheng

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEndoplasmic reticulumCell biologyArabidopsisATG8AutophagyUnfolded protein responseMutantHomomericBiologyChemistryReceptorBiochemistryProtein subunitGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ROOT HAIR DEFECTIVE3 (RHD3) is a plant member of atlastin GTPases, which belong to an evolutionally conserved family of proteins that mediate the homotypic fusion of the endoplasmic reticulum (ER). An atlastin in mammalian cells has recently been shown to act as an ER-phagy receptor for selective autophagy of the ER (ER-phagy) during nutrient starvation. Although RHD3 has been indicated to play a role in ER stress response, it is not very clear how RHD3 is involved in the process. In this study, we showed that the rhd3 mutant is hyposensitive to ER as well as salt stress. We employed an YFP-tagged ER membrane marker YFP-TMC to monitor the efficiency of ER-phagy microscopically and biochemically. We found that rhd3 is defective in ER-phagy under ER stress. Furthermore, there is an increased association of YFP-RHD3 with ATG8e-marked autophagosomes. YFP-RHD3 is also visible with ATG8e in the vacuole, and there is a breakdown of YFP-RHD3 under ER stress. RHD3 has two putative ATG8 interaction motifs (AIM1-2). We revealed that RHD3 but not RHD3(ΔAIM1) physically interacts with ATG8, a core autophagosomal component that interacts with various receptor proteins to recruit cargos for degradation by selective autophagy. Furthermore, their interaction is enhanced under ER stress. We thus propose that RHD3 acts as an ER-phagy receptor under ER stress to promote ER-phagy in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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