Novel mutation in <i>PIK3CD</i> affecting the Ras-binding domain
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The phosphoinositide 3-kinase (PI3K) pathway plays critical roles in diverse cellular processes, including differentiation, proliferation, motility, survival, and growth. PI3Kδ, comprised of the catalytic subunit p110δ and regulatory subunit p85α, is essential for normal lymphocyte and myeloid development and function. Gain-of-function mutations in PIK3CD (encoding p110δ) cause a combined immunodeficiency known as activated PI3Kδ syndrome (APDS), in which patients frequently present with recurrent respiratory infections, severe recurrent (or persistent) infections with herpes family viruses, and lymphadenopathy. Aim: To describe the clinical presentation, immune evaluation, and genetic work-up of 2 patients (daughter and mother) with recurrent sinopulmonary, soft tissue, and skin infections. Results: Both daughter and mother presented with recurrent sinopulmonary and soft tissue infections. Immune evaluation of the daughter revealed intermittent hypogammaglobulinemia and abnormal specific vaccine responses, while immune parameters of her mother were normal. Whole exome sequencing identified a novel mutation in PIK3CD (NM_005026), c.C719T, resulting in p.T240M. Western blot analysis of downstream AKT levels revealed increased basal phosphorylation, in line with gain-of-function mutations of PIK3CD. Conclusion: The novel missense mutation in PIK3CD occurs in the region encoding the Ras-binding domain (RBD) of p110δ, and likely alters the structural configuration of the domain. To date, pathogenic mutations targeting the RBD of p110δ have not yet been described. Our results expand on the genotypic spectrum of APDS. Statement of Novelty: We describe a novel mutation in the Ras-binding domain of PIK3CD leading to a presentation of recurrent sinopulmonary and soft tissue infections in the context of APDS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».