Avoiding false positive SARS-CoV-2 rapid antigen test results with point-of-care molecular testing on residual test buffer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Objectives Antigen-based rapid diagnostic tests (Ag-RDTs) have been widely used for the detection of SARS-CoV-2 during the Covid-19 pandemic. In settings of low disease prevalence, such as asymptomatic community testing, national guidelines recommend molecular confirmation of positive Ag-RDT results. This often requires patients to be recalled for repeat specimen recollection and subsequent testing in reference laboratories. This project assessed the use of a point-of-care molecular method for SARS-CoV-2 detection on-site at a volunteer-led asymptomatic community testing site, using the residual test buffer (RTB) from positive Ag-RDTs. Methods The Abbott COVID-19 ID NOW assay was performed on RTB from two Ag-RDTs: the Abbott Panbio COVID-19 Ag Rapid Test Device and the BTNX Rapid Response COVID-19 Antigen Rapid Test Device. All RTBs were tested using real-time RT-PCR at a reference laboratory using the ThermoFisher TaqPath COVID-19 Combo kit which was used to assign positive Ag-RDTs results as true or false positives. Analytical specificity of the ID NOW was assessed with a panel of various respiratory organisms. Results Of 419 positive Ag-RDTs from 5148 tests performed, ID NOW testing of the RTB was positive in 100% of the samples characterized as true positives by RT-PCR. No SARS-CoV-2 detections by ID NOW were observed from 10 specimens characterized as false positive Ag-RDTs, or from contrived specimens with various respiratory organisms. Conclusions The use of on-site molecular testing on RTB provides a suitable option for rapid confirmatory testing of positive Ag-RDTs, thereby obviating the need for specimen recollection for molecular testing at local reference laboratories.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».