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Enregistrement W4213455486 · doi:10.1139/facets-2021-0052

Way out there: pathogens, health, and condition of overwintering salmon in the Gulf of Alaska

2022· article· en· W4213455486 sur OpenAlexaffvenue
Christoph Deeg, А. Н. Канзепарова, Alexei Somov, Svetlana Esenkulova, Emiliano Di Cicco, Karia H. Kaukinen, Amy Tabata, Tobi J. Ming, Shaorong Li, Gideon Mordecai, Angela D. Schulze, Kristina M. Miller

Notice bibliographique

RevueFACETS · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaPacific Salmon FoundationUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOverwinteringBiologyFisheryEcosystemPredationOncorhynchusEcologyStock (firearms)GeographyFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmon are keystone species across the North Pacific, supporting ecosystems, commercial opportunities, and cultural identity. Nevertheless, many wild salmon stocks have experienced significant declines. Salmon restoration efforts focus on fresh and coastal waters, but little is known about the open ocean environment. Here we use high throughput RT-qPCR tools to provide the first report on the health, condition, and infection profile of coho, chum, pink, and sockeye salmon in the Gulf of Alaska during the 2019 winter. We found lower infectious agent number, diversity, and burden compared with coastal British Columbia in all species except coho, which exhibited elevated stock-specific infection profiles. We identified Loma sp. and Ichthyophonus hoferi as key pathogens, suggesting transmission in the open ocean. Reduced prey availability, potentially linked to change in ocean conditions due to an El Niño event, correlated with energetic deficits and immunosuppression in salmon. Immunosuppressed individuals showed higher relative infection burden and higher prevalence of opportunistic pathogens. We highlight the cumulative effects of infection and environmental stressors on overwintering salmon, establishing a baseline to document the impacts of a changing ocean on salmon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,505

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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