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Enregistrement W4214492651 · doi:10.1101/2022.02.25.481812

Hippocampal GFAP-positive astrocyte responses to amyloid and tau pathologies

2022· preprint· en· W4214492651 sur OpenAlexafffund
Marco Antônio De Bastiani, Bruna Bellaver, Wagner S. Brum, Débora Guerini de Souza, Pâmela C.L. Ferreira, Andréia Silva da Rocha, Guilherme Povala, João Pedro Ferrari‐Souza, Andréa Lessa Benedet, Nicholas J. Ashton, Thomas K. Karikari, Henrik Zetterberg, Kaj Blennow, Pedro Rosa‐Neto, Tharick A. Pascoal, Eduardo R. Zimmer

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéInstituto SerrapilheiraCanadian Institutes of Health ResearchAlzheimerfondenInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Excitotoxicidade e NeuroproteçãoUK Dementia Research InstituteVetenskapsrådetFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do SulParkinsonfondenHjärnfondenConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchEuropean CommissionStiftelsen för Gamla TjänarinnorFamiljen Erling-Perssons StiftelseInternational Society for NeurochemistryBrightFocus FoundationAlzheimer's AssociationConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementAlzheimer's Drug Discovery Foundation
Mots-clésAstrocyteGlial fibrillary acidic proteinAstrogliosisBiologyContext (archaeology)TranscriptomeBiomarkerHippocampal formationNeurosciencePathologyNeurodegenerationGeneGene expressionMedicineImmunologyDiseaseGeneticsCentral nervous systemImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction In Alzheimer’s disease clinical research, glial fibrillary acidic protein (GFAP) released into the cerebrospinal fluid and blood is widely measured and perceived as a biomarker of reactive astrogliosis. However, it was demonstrated that GFAP levels differ in individuals presenting with amyloid-β (Aβ) or tau pathology. The molecular underpinnings behind this specificity are unexplored. Here we investigated biomarker and transcriptomic associations of GFAP-positive astrocytes with Aβ and tau pathologies in humans and mouse models. Methods We studied 90 individuals with plasma GFAP, Aβ- and Tau-PET to investigate the association between biomarkers. Then, transcriptomic analysis in hippocampal GFAP-positive astrocytes isolated from mouse models presenting Aβ (PS2APP) or tau (P301S) pathologies was applied to explore differentially expressed genes (DEGs), Gene Ontology processes, and protein-protein interaction networks associated with each phenotype. Results In humans, we found that plasma GFAP associates with Aβ but not tau pathology. Unveiling the unique nature of GFAP-positive astrocytic responses to Aβ or tau pathology, mouse transcriptomics showed scarce overlap of DEGs between the Aβ and tau mouse models, While Aβ GFAP-positive astrocytes were overrepresented with genes associated with proteostasis and exocytosis-related processes, tau hippocampal GFAP-positive astrocytes presented greater abnormalities in functions related to DNA/RNA processing and cytoskeleton dynamics. Conclusion Our results offer insights into Aβ- and tau-driven specific signatures in GFAP-positive astrocytes. Characterizing how different underlying pathologies distinctly influence astrocyte responses is critical for the biological interpretation of astrocyte-related biomarker and suggests the need to develop context-specific astrocyte targets to study AD. Funding This study was supported by Instituto Serrapilheira, Alzheimer’s Association, CAPES, CNPq and FAPERGS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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