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Enregistrement W4214493842 · doi:10.31219/osf.io/24gm3

Insufficient Evidence for “Autism-Specific” Genes

2020· preprint· en· W4214493842 sur OpenAlexaff
Scott M. Myers, Thomas D. Challman, Raphael Bernier, Thomas Bourgeron, Wendy K. Chung, John N. Constantino, Evan E. Eichler, Sébastien Jacquemont, David T. Miller, Kevin J. Mitchell, Huda Y. Zoghbi, David H. Ledbetter

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Mental HealthNational Institutes of HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentUniversité de Paris
Mots-clésAutismPhenotypeGeneAutism spectrum disorderGeneticsBiologyHeritability of autismPsychologyDevelopmental psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the evidence that deleterious variants in the same genes are implicated across multiple neurodevelopmental disorders, there has been considerable interest in identifying genes that, when mutated, confer risk that is largely specific for autism spectrum disorder (ASD). Here, we review recent efforts to identify “autism-specific” genes, which focus on rare variants of large effect size that are thought to account for the observed phenotype in participants, present a divergent interpretation of the published evidence, and provide additional contradictory data. There is currently insufficient evidence to establish ASD-specificity of any genes based on large-effect rare variant data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,032
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,115
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0320,115
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,309
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,095 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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