Faculty Opinions recommendation of Food reservoir for Escherichia coli causing urinary tract infections.
Notice bibliographique
Résumé
Closely related strains of Escherichia coli have been shown to cause extraintestinal infections in unrelated persons. This study tests whether a food reservoir may exist for these E. coli. Isolates from 3 sources over the same time period (2005-2007) and geographic area were compared. The sources comprised prospectively collected E. coli isolates from women with urinary tract infection (UTI) (n = 353); retail meat (n = 417); and restaurant/ready-to-eat foods (n = 74). E. coli were evaluated for antimicrobial drug susceptibility and O:H serotype and compared by using 4 different genotyping methods. We identified 17 clonal groups that contained E. coli isolates (n = 72) from >1 source. E. coli from retail chicken (O25:H4-ST131 and O114:H4-ST117) and honeydew melon (O2:H7-ST95) were indistinguishable from or closely related to E. coli from human UTIs. This study provides strong support for the role of food reservoirs or foodborne transmission in the dissemination of E. coli causing common community-acquired UTIs. PMID: 20031048 Funding information This work was supported by: Canadian Institutes of Health Research, Canada Grant ID: CGM84898
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,074 | 0,031 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».