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Enregistrement W4214522216 · doi:10.1002/cjs.11695

Penalized likelihood ratio test for a biomarker threshold effect in clinical trials based on generalized linear models

2022· article· en· W4214522216 sur OpenAlexafffundvenue
Parisa Gavanji, Wenyu Jiang, Bingshu E. Chen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Statistics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLikelihood-ratio testMathematicsCovariateScore testGeneralized linear modelTest statisticStatisticsPoisson distributionNull hypothesisAsymptotic distributionStatistical hypothesis testingLogistic regressionLikelihood functionHomogeneity (statistics)Applied mathematicsEstimation theory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In a clinical trial, the responses to the new treatment may vary among patient subsets with different characteristics in a biomarker. It is often necessary to examine whether there is a cutpoint for the biomarker that divides the patients into two subsets of those with more favourable and less favourable responses. More generally, we approach this problem as a test of homogeneity in the effects of a set of covariates in generalized linear regression models. The unknown cutpoint results in a model with nonidentifiability and a nonsmooth likelihood function to which the ordinary likelihood methods do not apply. We first use a smooth continuous function to approximate the indicator function defining the patient subsets. We then propose a penalized likelihood ratio test to overcome the model irregularities. Under the null hypothesis, we prove that the asymptotic distribution of the proposed test statistic is a mixture of chi‐squared distributions. Our method is based on established asymptotic theory, is simple to use, and works in a general framework that includes logistic, Poisson, and linear regression models. In extensive simulation studies, we find that the proposed test works well in terms of size and power. We further demonstrate the use of the proposed method by applying it to clinical trial data from the Digitalis Investigation Group (DIG) on heart failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,107
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,345
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,568

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1070,345
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,577
Tête enseignante GPT0,550
Écart entre enseignants0,027 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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