Patterns of multiple enteric infections in a 10-year longitudinal study in British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: Enteric infections are a global public health issue, in part because long-term sequelae can occur post-infection.Complicating risk estimation of sequela, such as acute kidney injury and inflammatory bowel diseases, after infections is the fact that individuals may have more than one infection including from different pathogens, concurrently or sequentially.Here, we investigated patterns of multiple infections within a retrospective, populationbased, longitudinal cohort study of enteric infections. Methods & Materials:We used provincial reportable disease data on laboratory-confirmed enteric infections ( Campylobacter, Cryptosporidium, Cyclospora, Giardia, hepatitis A , Listeria, nontyphoidal Salmonella spp , Salmonella Typhi , Salmonella Paratyphi , STEC , Shigella, Yersinia (excluding pestis) , and Vibrio parahaemolyticus ) from 2005 to 2014 inclusive.infections were considered incident if a subsequent infection caused by the same pathogen had an onset date > 90 days after the prior infection ( > 730 days for Giardia ; no recurrence for hepatitis A) .Population data were obtained from the provincial health insurance program, and included demographics and the number of days individuals were registered in the program.Results: Our cohort included 5,819,344 individuals followed for an average of 7.6 years.Within the cohort, 41,229 individuals had 43,308 infections (96.4 infections per 10 0,0 0 0 person-years), of whom 1,641 (4.0%) experienced more than one infection.Most individuals with multiple infections had two incident infections from two different pathogens; 308 (25.1%) had them concurrently.The most frequent concurrent pathogen pairs were Campylobacter and non-typhoidal Salmonella (n = 118) and the most frequent pairs at different times were Campylobacter and Yersinia (n = 142).An additional 18.5% (303/1,641) of individuals had between three and five infections across the study period, all from the same pathogen; the most frequent were Campylobacter (n = 122), Yersinia (n = 58), and Giardia (n = 58).The time to the same subsequent incident infection varied by pathogen and was shortest for non-typhoidal Salmonella (median = 288 days) and longest for Giardia (median = 1281 days). Conclusion:The potential for these multiple infections to increase the risk of sequelae compared with single infections should be explored when assessing post-infection sequelae risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».