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Enregistrement W4214553147 · doi:10.1111/mec.16411

Bacterial‐fungal interactions and their impact on microbial pathogenesis

2022· review· en· W4214553147 sur OpenAlexafffund
Jessie MacAlpine, Nicole Robbins, Leah E. Cowen

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthW. Garfield Weston Foundation
Mots-clésBiologyCandida albicansHuman microbiomeCryptococcus neoformansMicrobiologyCommensalismVirulenceDiseaseHuman healthMicrobiomeBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microbial communities of the human microbiota exhibit diverse effects on human health and disease. Microbial homeostasis is important for normal physiological functions and changes to the microbiota are associated with many human diseases including diabetes, cancer, and colitis. In addition, there are many microorganisms that are either commensal or acquired from environmental reservoirs that can cause diverse pathologies. Importantly, the balance between health and disease is intricately connected to how members of the microbiota interact and affect one another's growth and pathogenicity. However, the mechanisms that govern these interactions are only beginning to be understood. In this review, we outline bacterial-fungal interactions in the human body, including examining the mechanisms by which bacteria govern fungal growth and virulence, as well as how fungi regulate bacterial pathogenesis. We summarize advances in the understanding of chemical, physical, and protein-based interactions, and their role in exacerbating or impeding human disease. We focus on the three fungal species responsible for the majority of systemic fungal infections in humans: Candida albicans, Cryptococcus neoformans, and Aspergillus fumigatus. We conclude by summarizing recent studies that have mined microbes for novel antimicrobials and antivirulence factors, highlighting the potential of the human microbiota as a rich resource for small molecule discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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