A Clinically Translatable Immune-based Classification of HPV-associated Head and Neck Cancer with Implications for Biomarker-Driven Treatment Deintensification and Immunotherapy
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose Human papillomavirus-associated (HPV + ) head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the fastest rising cancer in North America. There is significant interest in treatment de-escalation for these patients given the generally favourable prognosis. However, 15-30% of patients recur after primary treatment, reflecting a need for improved risk-stratification tools. We sought to develop a molecular test to predict the survival of patients with newly diagnosed HPV + HNSCC. Methods We created a prognostic score (UWO3) that was successfully validated in six independent cohorts comprising 906 patients, including blinded retrospective and prospective external validations. Transcriptomic data from two aggressive radiation de-escalation cohorts were used to assess the ability of UWO3 to identify patients who recur. Multivariate Cox models were used to assess the associations between the UWO3 immune class and outcomes. Results A three-gene immune score classified patients into three immune classes (immune rich, mixed, or immune desert) and was strongly associated with disease-free survival in six datasets, including large retrospective and prospective datasets. Pooled analysis demonstrated that the immune rich group had superior disease-free survival at 5 years to the immune desert (HR= 9.0, 95% CI 3.2–25.5, P =3.6×10 −5 ) and mixed (HR=6.4, 95%CI 2.2–18.7, P =0.006) groups after adjusting for age, sex, smoking status, and AJCC8 clinical stage. Finally, UWO3 was able to identify patients from two treatment de-escalation cohorts who remain disease-free after aggressive de-escalation to 30 Gy radiation. Conclusions The UWO3 immune score could enable biomarker-driven clinical decision-making for patients with HPV + HNSCC based on robust outcome prediction across six independent cohorts. The superior survival of immune rich patients supports de-intensification strategies, while the inferior outcomes of the immune desert patients suggest the potential for intensification and/or immunotherapy. Prospective de-escalation and intensification clinical trials are currently being planned.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».