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Enregistrement W4214630085 · doi:10.1016/j.ijid.2021.12.252

SARS-CoV-2 Surveillance in Peri-Domestic and Wildlife Species in Ontario, Canada

2022· article· en· W4214630085 sur OpenAlexaffabout
Jonathon D. Kotwa, Angelo Sotto, Lily Yip, Annabel Hou, Tore Buchanan, J.C. Bowman, Janet E. Greenhorn, Larissa Nituch, L. Bruce, Samira Mubareka

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensTrent UniversityMinistry of Natural Resources and ForestryUniversity of TorontoSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriWildlifeSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakGeographyEnvironmental protectionEnvironmental healthFisheryVirologyOutbreakMedicineBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methods & Materials: Documentation on the outbreak response from the Ministries of Environment.Water and Agriculture (MEWA) and Health (MOH) were reviewed.With an experienced wildlife veterinarian from the Wildlife Authority added, the review team sought to understand the possible transmission pathways to the sand cat.Additonally, it sought to characterize the potential direct and indirect public health threats to man and animalsResults: The rabies outbreak and spillover event were due to an unprovoked attack on a 55-year-old farmer on his farm by a sand cat in Sharri, a village in the Qaseem region of Saudi Arabia.The victim killed the cat prior to presenting for medical attention.The coordinated and rapid One Health response between MEWA and MOH led to the rapid diagnosis of rabies in the brain of the sand cat using Direct Fluorescent Antibody testing.The small size and solitary life style of the sand cat in its harsh, desert habitat in Central Saudi Arabia provoked theories of cross-species transmission from known primary reservoirs: bats or foxes.The prevailing passive nature of rabies surveillance and the lack of a robust laboratory surveillance mechanism precluded confirmation of these theories by viral characterization.We observed that ongoing uncontrolled illegal poaching and online sales of sand cat could serve as pathways for future rabies spillovers in man and other animals.Additionally, spillovers can potentially involve other pathogens primarily or secondarily harbored by sand cats.Conclusion: This first report of rabies in sand cats further highlights how the One Health approach in disease control and prevention and pathogen spillover monitoring.Furthermore, enhanced rabies spillover surveillance at the wildlife-domestic animal interface can be leveraged with to understand other possible pathogen spillovers in our desert ecosystem.The need for strengthening the domestic and wildlife surveillance mechanism, including having dedicate animal control officers, cannot be overemphasized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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