Extensive Diversity and Prevalent Fluconazole Resistance among Environmental Yeasts from Tropical China
Notice bibliographique
Résumé
Yeasts play important roles in both the environment and in human welfare. While some environmental yeasts positively contribute to nutrient cycling and food production, a significant number of yeast species are opportunistic human pathogens, including several that are tolerant/resistant to commonly used antifungal drugs. At present, most of our understanding of environmental yeasts has come from a few terrestrial environments in selected geographic regions. Relatively little is known about yeast diversity in tropical environments and their potential impacts on human health. Here, we characterize culturable yeasts in 968 environmental samples from eight regions in tropical China. Among the 516 soil, 273 freshwater, and 179 seawater samples, 71.5%, 85.7%, and 43.6% contained yeasts, respectively. A total of 984 yeast isolates were analyzed for their DNA barcode sequences and their susceptibilities to fluconazole. DNA sequence comparisons revealed that the 984 yeast isolates likely belonged to 144 species, including 106 known species and 38 putative novel species. About 38% of the 984 isolates belonged to known human pathogens and the most common species was Candida tropicalis, accounting for 21% (207/984) of all isolates. Further analyses based on multi-locus sequence typing revealed that some of these environmental C. tropicalis shared identical genotypes with clinical isolates previously reported from tropical China and elsewhere. Importantly, 374 of the 984 (38%) yeast isolates showed intermediate susceptibility or resistance to fluconazole. Our results suggest that these environmental yeasts could have significant negative impacts on human health.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».