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Enregistrement W4214642776 · doi:10.3390/genes13030444

Extensive Diversity and Prevalent Fluconazole Resistance among Environmental Yeasts from Tropical China

2022· article· en· W4214642776 sur OpenAlexaff
Yiwei Liu, Zhongyao Chen, Jingyuan Li, Sibei Pang, Jianping Xu, Jinyan Wu

Notice bibliographique

RevueGenes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Hainan ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyCandida tropicalisYeastMultilocus sequence typingFluconazoleCladeMicrobiologyEcologyZoologyPhylogeneticsGenotypeAntifungalGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yeasts play important roles in both the environment and in human welfare. While some environmental yeasts positively contribute to nutrient cycling and food production, a significant number of yeast species are opportunistic human pathogens, including several that are tolerant/resistant to commonly used antifungal drugs. At present, most of our understanding of environmental yeasts has come from a few terrestrial environments in selected geographic regions. Relatively little is known about yeast diversity in tropical environments and their potential impacts on human health. Here, we characterize culturable yeasts in 968 environmental samples from eight regions in tropical China. Among the 516 soil, 273 freshwater, and 179 seawater samples, 71.5%, 85.7%, and 43.6% contained yeasts, respectively. A total of 984 yeast isolates were analyzed for their DNA barcode sequences and their susceptibilities to fluconazole. DNA sequence comparisons revealed that the 984 yeast isolates likely belonged to 144 species, including 106 known species and 38 putative novel species. About 38% of the 984 isolates belonged to known human pathogens and the most common species was Candida tropicalis, accounting for 21% (207/984) of all isolates. Further analyses based on multi-locus sequence typing revealed that some of these environmental C. tropicalis shared identical genotypes with clinical isolates previously reported from tropical China and elsewhere. Importantly, 374 of the 984 (38%) yeast isolates showed intermediate susceptibility or resistance to fluconazole. Our results suggest that these environmental yeasts could have significant negative impacts on human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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