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Enregistrement W4214643895 · doi:10.3390/ijms23052724

Metabolomic and Transcript Analysis Revealed a Sex-Specific Effect of Glyphosate in Zebrafish Liver

2022· article· en· W4214643895 sur OpenAlexafffund
Christian Giommi, Claudia Ladisa, Oliana Carnevali, Francesca Maradonna, Hamid R. Habibi

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePesticide and Herbicide Environmental Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta InnovatesCanterbury Medical Research FoundationInternational Microbiome Centre, University of CalgaryUniversity of Calgary
Mots-clésBiologyOxidative stressGlyphosatePurineMetabolomicsZebrafishMetabolismInternal medicineEndocrinologyBiochemistryGeneMedicineEnzymeBiotechnologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glyphosate is a component of commonly used herbicides for controlling weeds in crops, gardens and municipal parks. There is increasing awareness that glyphosate-based herbicides, in addition to acting on plants, may also exert toxicity in wildlife and humans. In this study, male and female adult zebrafish were exposed to 700 µg/L of glyphosate (GLY), for 28 days. We used the metabolomic approach and UHPLC-ESI-MS to analyze liver samples to investigate the adverse effects of glyphosate on hepatic metabolism. The impact of GLY was found to be sex-specific. In female, GLY exposure affected purine metabolism by decreasing the levels of AMP, GMP and inosinic acid, consequently increasing uric acid levels with respect to the control (CTRL). Exposure to GLY also caused a decrease of UMP levels in the pyrimidine metabolism pathway. In male, GLY exposure decreased the aminoadipic acid within the lysine degradation pathway. Transcript analysis of genes involved in stress response, oxidative stress and the immune system were also performed. Results demonstrated an increased stress response in both sexes, as suggested by higher nr3c1 expression. However, the hsp70.2 transcript level was increased in female but decreased in male. The results demonstrated reduced sod1, sod2, and gpx1a in male following exposure to GLY, indicating an impaired oxidative stress response. At the same time, an increase in the cat transcript level in female was observed. mRNA levels of the pro-inflammatory interleukins litaf and cxcl8b.1 were increased in female. Taken together, the results provide evidence of disrupted nucleotide hepatic metabolism, increased stress inflammatory response in female and disruption of oxidative stress response in male.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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