Assessment of private variants in <i>PRKN, PARK7</i> and <i>PINK1</i> in Parkinson’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Recessive mutations in PRKN, PARK7 and PINK1 are established causes of early-onset Parkinson’s disease (EOPD). Previous studies have interrogated the role of heterozygous variants in these genes but mainly focused on rare (minor allele frequency [MAF] <1%) damaging variants or established mutations. Here, we assessed heterozygous private PRKN, PARK7 and PINK1 variants in PD risk in four large-scale PD case-control datasets by performing gene-wise burden analyses using sequencing data totaling 5,829 PD cases and 7,221 controls, and summary allele counts from 9,501 PD cases and 48,207 controls. Results showed no significant burden in all three genes after meta-analyses. Burden in EOPD (age at onset <50 years) and late-onset PD (≥50 years) remained nonsignificant. In summary, we found no evidence to support the association of the excess burden of heterozygous private variants in PRKN, PARK7 , and PINK1 with PD risk in the European population. Larger, more diverse cohorts are needed to accurately determine their role in PD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».