Characterization of Alistipes montrealensis sp. nov., Isolated from Human Feces of a Patient with Metastatic Melanoma Treated with Immune Checkpoint Inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
Fecal microbiome culturomics of a cancer patient treated with immune checkpoint inhibitors led to the identification of a Gram-negative, rod-shaped, obligate anaerobic, non-motile, non-spore-forming bacterium, designated strain kh20T, which was phylogenetically assigned to the genus Alistipes. Strain kh20T demonstrated a 98.61% 16S rRNA sequence similarity with A.shahii WAL 8301T. The bacteria cells generated catalase but no oxidase. Iso-C15:0 (26.6%), anteiso-C15:0 (19.9%), and iso-C17:0 (17.2%) were the major cellular fatty acids identified in its composition. The G+C content of its genome was 57.2%. Strain kh20T showed significantly low values for DNA-DNA Hybridation (DDH ≤ 33.70%) and Average Nucleotide Identity (ANI ≤ 86.35%) compared with other Alistipes species. Based on these findings, we concluded that strain kh20T represented a novel bacterium, and we proposed the name Alistipes montrealensis sp. nov. (CECT 30384 and CSUR Q6005).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».