The Protein Interactome of a Nanoparticle Population in Whole Cytoplasm under Near‐Native Conditions: A Pilot Study
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The surface interactions of nanoparticles (NPs) with proteins are intensively studied because they partly determine the biological fate of these reagents. The protein interaction trajectory of NPs delivered from complex biofluids into the cytosol of vertebrate cells however remains poorly characterized. This topology is explored using isolated whole cytoplasm and carboxylated superparamagnetic iron oxide NPs (SPIONs). SPIONs are introduced into the cytoplasm in naked form or with an adsorbed cargo of serum proteins as an example of a complex NP “corona.” By filtering interactome datasets with information about protein localization and absolute cytosolic concentration, the soluble cytoplasmic proteins that contribute to corona formation in the cytoplasm are identified. These include a subset of glycolytic enzymes and proteins in soluble ribosomes. In the cytoplasm, the proteins of the serum corona are quickly removed from SPIONs by a non‐proteolytic mechanism. Although naked SPIONs and SPIONs with a serum corona capture the same 65 cytosolic proteins, their overall interaction trajectory in the cytoplasm is not identical. In particular, they diverge in engagement with macroscale cell parts such as mitochondria. This knowledge of the interaction landscape of NPs in the cytoplasm is expected to support hypothesis development in projects aimed at improving NP reagents for biomedical applications.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle