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Enregistrement W4214733532 · doi:10.1111/jac.12586

Temporal transcriptomes unravel the effects of heat stress on seed germination during wheat grain filling

2022· article· en· W4214733532 sur OpenAlexaff
Yu He, Wen Huang, Zhien Pu, Mengping Cheng, Yujiao Liu, Pengfei Qi, Xiaojiang Guo, Qiantao Jiang, Yuming Wei, Jirui Wang

Notice bibliographique

RevueJournal of Agronomy and Crop Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGerminationAbscisic acidGibberellinDormancyTranscriptomeBiologyGeneSeed dormancyGene expressionHorticultureAgronomyBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Promoting seed germination after short episodes of heat stress during the wheat grain filling stage is a serious problem that results in pre‐harvest sprouting. The plant hormones abscisic acid (ABA), gibberellins (GAs), and ethylene (ETH) are well known to be involved in germination control. However, the genes associated with the metabolism and responsiveness of these hormones to heat stress during wheat grain filling are not well understood. Transcriptomic analysis was carried out to explore the mechanisms controlling seed germination under five days (15–20 days after flowering, DAF) of heat stress (20, 24, 28, and 32°C) in wheat grains at 15–30 DAF using comparative RNA sequencing. A dataset of 2073 differentially regulated genes was used to help elucidate the molecular mechanisms that respond to heat stress and affect seed germination in wheat. Some genes related to ABA, GA, and ETH biosynthesis, transport, and signaling had significantly different expression levels under heat stress. Among these genes, the transcriptional alterations of plant hormone‐related genes, such as NCED9 , AAO3 , CYP707A2 , GA20ox , and SAM1 uncovered here, provide a foundation for identifying key players involved in determining seed dormancy and germination. The expression levels of many germination‐related genes did not linearly increase with increasing temperature. In this study, 28°C is a threshold of temperature tolerance during the grain filling stage. Heat stress, especially extremely high temperature (>28°C), represses ABA‐related gene expression and promotes seed germination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,892
Score d'incertitude au seuil0,465

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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