Progenitor cell-derived basophils: a novel barcoded passive degranulation assay in allergy diagnosis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Effector cells assays provide an overall measure of responsiveness to allergen, but the lack of reliable, high-throughput assays limits the clinical utility of this approach. The aim of this study was to develop a high-throughput Basophil Activation Test (BAT), based on human progenitor cell-derived basophils (PCB), and to investigate the role of PCB activation test (PCBAT) in allergy diagnosis. Methods: PCBs were differentiated from CD34+ progenitor cells, and sensitized with sera from subjects sensitized to cat (n=35, 17 subjects clinical reactivity validated), peanut-allergic (n=30, 15 subjects clinical reactivity validated), peanut-sensitized but tolerant subjects (n=13). Sensitized PCBs were then stimulated with a range of concentrations of the corresponding allergens and degranulation was measured using CD63 expression on flow cytometry. Results: Following passive sensitisation of the mature PCB (2D7+/FcεRI+/CD117-/HLADR-) with serum and stimulation with allergen, we saw a dose-dependent increase in CD63 expression which was allergen specific. In subjects sensititsed to cat there was a positive correlation between PCBAT area under curve (AUC) versus specific IgE (sIgE) to cat (p=0.001) and versus airway responsiveness to inhaled cat allergen (p=0.026). There was a significant negative correlation between PCBAT AUC for peanut allergen and response to oral food challenge test to peanut - subjects with higher PCBAT AUC reacted to a lower dose on the oral food challenge to peanut (p=0.001), and had higher sIgE to Ara h 1 (p=0.007). All peanut tolerant subjects showed no reaction to peanut on PCBAT. Conclusion: PCBAT may confer a powerful alternative tool in allergy testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».