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Enregistrement W4214810777 · doi:10.1055/s-0042-1743626

Establishing Prognostic DNA Methylation-Based Chordoma Subgroups in Tissue that are Detectable in Plasma

2022· article· en· W4214810777 sur OpenAlexaff
Jeffrey Zuccato, Vikas Patil, Sheila Mansouri, Jeffrey Liu, Farshad Nassiri, Yasin Mamatjan, Ankur Chakravarthy, Shirin Karimi, João Paulo Almeida, Anne-Laure Bernat, Mohammed Hasen, Olivia Singh, Shahbaz Khan, Thomas Kislinger, Namita Sinha, Sébastien Froelich, Homa Adle‐Biassette, Kenneth Aldape, Daniel D. De Carvalho, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurological Surgery Part B Skull Base · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone Tumor Diagnosis and Treatments
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChordomaSkullPathologicalMedicineRadiation therapyOncologyDNA methylationInternal medicineBioinformaticsSurgeryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Chordomas are bony tumors of skull base and spine that make up 2 to 4% of aggressive primary bone cancers. Despite standard of care treatment with surgery and radiotherapy, around half of patients recur, experience further neurological morbidity, and die within 4 years while the remaining half survive over 10 to 20 years. Unfortunately, these clinically aggressive and clinically benign subsets of chordoma cannot be reliably identified using existing clinical, pathological, or molecular factors/features to guide treatment approaches. Accordingly, this work aims to identify prognostic DNA methylation-based subgroups of chordomas and to establish feasibility for subgroup identification noninvasively, so that patients may be prognosticated at the time of diagnosis to guide treatment decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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