Peer Review #1 of "Genome-wide evolution and expression analysis of the MYB-CC gene family in Brassica spp. (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
The MYB-CC family is a subtype within the MYB superfamily.This family contains a MYB domain and a predicted coiled-coil (CC) domain.Several MYB-CC transcription factors are involved in the plant's adaptability to low phosphate (Pi) stress.We identified 30, 34, and 55 MYB-CC genes in Brassica rapa, Brassica oleracea, and Brassica napus, respectively.The MYB-CC genes were divided into nine groups based on phylogenetic analysis.The analysis of the chromosome distribution and gene structure revealed that most MYB-CC genes retained the same relative position on the chromosomes and had similar gene structures during allotetraploidy.Evolutionary analysis showed that the ancestral wholegenome triplication (WGT) and the recent allopolyploidy are critical for the expansion of the MYB-CC gene family.The expression patterns of MYB-CC genes were found to be diverse in different tissues of the three Brassica species.Furthermore, the gene expression analysis under low Pi stress revealed that MYB-CC genes may be related to low Pi stress responses.These results may increase our understanding of MYB-CC gene family diversification and provide the basis for further analysis of the specific functions of MYB-CC genes in Brassica species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,060 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,006 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,280 | 0,184 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».