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Enregistrement W4214885682 · doi:10.1101/2022.02.24.22271438

Pegylated-interferon-λ treatment-induced peripheral interferon stimulated genes are associated with SARS-CoV-2 viral load decline despite delayed T cell response in older individuals

2022· preprint· en· W4214885682 sur OpenAlexafffund
Deanna M. Santer, Daniel Li, Yanal Ghosheh, Muhammad Atif Zahoor, Dhanvi Prajapati, D. Lorne Tyrrell, Jordan J. Feld, Adam J. Gehring

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaToronto Liver CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Mots-clésInterferonImmunologyImmunityImmune systemViral loadVirologyAcquired immune systemVirusT cellInnate immune systemAntibodyBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Interferons (IFNs) are antiviral cytokines induced very early after SARS-CoV-2 infection and are crucial for viral clearance, shaping immunity, and preventing the development of severe COVID-19. We previously demonstrated that a single injection of peginterferon-lambda1 (PEG-IFN-λ) accelerated viral clearance in COVID-19 patients. To determine if the rapid viral decline was mediated by enhanced immunity, we assessed in vivo responses to PEG-IFN-λ by single cell RNA sequencing and measured SARS-CoV-2-specific T cell and antibody responses between placebo and PEG-IFN-λ-treated patients. PEG-IFN-λ treatment induced interferon stimulated genes in peripheral immune cells expressing IFNLR1 , with plasmacytoid dendritic cells having the greatest response, followed by B cells. PEG-IFN-λ did not significantly affect SARS-CoV-2-specific antibody levels in plasma or the magnitude or functionality of virus-specific T cells. However, we identified a delayed T cell response in older adults, suggesting that PEG-IFN-λ can overcome the delay in adaptive immunity to accelerate viral clearance in patients most at risk for severe disease. Taken together, PEG-IFN-λ offers an early COVID-19 treatment option for outpatients to boost innate antiviral defenses without dampening peripheral SARS-CoV-2 adaptive immunity

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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