The relation between age and airway epithelial barrier function
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The prevalence of age-associated diseases, such as chronic obstructive pulmonary disease (COPD), is increasing as the average life expectancy increases around the world. We previously identified a gene signature for ageing in the human lung which included genes involved in apical and tight junction assembly, suggesting a role for airway epithelial barrier dysfunction with ageing. AIM: To investigate the association between genes involved in epithelial barrier function and age both in silico and in vitro in the airway epithelium. METHODS: We curated a gene signature of 274 genes for epithelial barrier function and tested the association with age in two independent cohorts of bronchial brushings from healthy individuals with no respiratory disease, using linear regression analysis (FDR < 0.05). Protein-protein interactions were identified using STRING©. The barrier function of primary bronchial epithelial cells at air-liquid interface and CRISPR-Cas9-induced knock-down of target genes in human bronchial 16HBE14o-cells was assessed using Trans epithelial resistance (TER) measurement and Electric cell-surface impedance sensing (ECIS) respectively. RESULTS: In bronchial brushings, we found 55 genes involved in barrier function to be significantly associated with age (FDR < 0.05). EPCAM was most significantly associated with increasing age and TRPV4 with decreasing age. Protein interaction analysis identified CDH1, that was negatively associated with higher age, as potential key regulator of age-related epithelial barrier function changes. In vitro, barrier function was lower in bronchial epithelial cells from subjects > 45 years of age and significantly reduced in CDH1-deficient 16HBE14o-cells. CONCLUSION: The significant association between genes involved in epithelial barrier function and age, supported by functional studies in vitro, suggest a role for epithelial barrier dysfunction in age-related airway disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».