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Enregistrement W4214925436 · doi:10.2196/30956

Reporting of Model Performance and Statistical Methods in Studies That Use Machine Learning to Develop Clinical Prediction Models: Protocol for a Systematic Review

2022· review· en· W4214925436 sur OpenAlexaffvenue
Colin Weaver, Robert B. Basmadjian, Tyler Williamson, Kerry McBrien, Tolulope T. Sajobi, Devon J. Boyne, Mohamed Yusuf, Paul E. Ronksley

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueArtificial Intelligence in Healthcare and Education
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMachine learningArtificial intelligenceProtocol (science)Computer scienceChecklistSystematic reviewPredictive modellingMEDLINEIdentification (biology)Data scienceMedicineAlternative medicinePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: With the growing excitement of the potential benefits of using machine learning and artificial intelligence in medicine, the number of published clinical prediction models that use these approaches has increased. However, there is evidence (albeit limited) that suggests that the reporting of machine learning-specific aspects in these studies is poor. Further, there are no reviews assessing the reporting quality or broadly accepted reporting guidelines for these aspects. OBJECTIVE: This paper presents the protocol for a systematic review that will assess the reporting quality of machine learning-specific aspects in studies that use machine learning to develop clinical prediction models. METHODS: We will include studies that use a supervised machine learning algorithm to develop a prediction model for use in clinical practice (ie, for diagnosis or prognosis of a condition or identification of candidates for health care interventions). We will search MEDLINE for studies published in 2019, pseudorandomly sort the records, and screen until we obtain 100 studies that meet our inclusion criteria. We will assess reporting quality with a novel checklist developed in parallel with this review, which includes content derived from existing reporting guidelines, textbooks, and consultations with experts. The checklist will cover 4 key areas where the reporting of machine learning studies is unique: modelling steps (order and data used for each step), model performance (eg, reporting the performance of each model compared), statistical methods (eg, describing the tuning approach), and presentation of models (eg, specifying the predictors that contributed to the final model). RESULTS: We completed data analysis in August 2021 and are writing the manuscript. We expect to submit the results to a peer-reviewed journal in early 2022. CONCLUSIONS: This review will contribute to more standardized and complete reporting in the field by identifying areas where reporting is poor and can be improved. TRIAL REGISTRATION: PROSPERO International Prospective Register of Systematic Reviews CRD42020206167; https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/display_record.php?RecordID=206167. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): RR1-10.2196/30956.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,226
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,382
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil0,955

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2260,382
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,006
Méta-épidémiologie (sens large)0,0180,026
Bibliométrie0,0180,019
Études des sciences et des technologies0,0050,007
Communication savante0,0100,011
Science ouverte0,0060,007
Intégrité de la recherche0,0100,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0430,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,971
Tête enseignante GPT0,814
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomainePrésentation des résultats
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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