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Enregistrement W4220662537 · doi:10.1016/j.chest.2021.12.674

Genetic Associations and Architecture of Asthma-COPD Overlap

2022· review· en· W4220662537 sur OpenAlexafffund
Catherine John, Anna L. Guyatt, Nick Shrine, Richard Packer, Thorunn A. Olafsdottir, Jiangyuan Liu, Lystra P. Hayden, Su H. Chu, Jukka Koskela, Jian’an Luan, Xingnan Li, Natalie Terzikhan, Hanfei Xu, Traci M. Bartz, Hans Petersen, Shuguang Leng, Steven A. Belinsky, Aivaras Cepelis, Ana I. Hernández Cordero, Ma’en Obeidat, Guðmar Þorleifsson, Deborah A. Meyers, Eugene R. Bleecker, Lori C. Sakoda, Carlos Iribarren, Yohannes Tesfaigzi, Sina A. Gharib, Josée Dupuis, Guy Brusselle, Lies Lahousse, Victor E. Ortega, Ingileif Jónsdóttir, Don D. Sin, Yohan Bossé, Maarten van den Berge, David C. Nickle, Jennifer K Quint, Ian Sayers, Ian P. Hall, Claudia Langenberg, Samuli Ripatti, Tarja Laitinen, Ann Chen Wu, Jessica Lasky‐Su, Per Bakke, Amund Gulsvik, Craig P. Hersh, Caroline Hayward, Arnulf Langhammer, Ben Brumpton, Kāri Stefánsson, Michael H. Cho, Louise V. Wain, Martin D. Tobin

Notice bibliographique

RevueCHEST Journal · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSanofi GenzymeNIHR Nottingham Biomedical Research CentreGenentechNIHR Leicester Biomedical Research CentreMitacsNational Institutes of HealthUniversity of LeicesterNational Heart, Lung, and Blood InstituteBritish Lung FoundationAstraZenecaUK Research and InnovationBritish Heart FoundationWellcome TrustBoehringer IngelheimMedImmuneGlaxoSmithKlineMedical Research CouncilBayerBiogenNational Institute for Health and Care ResearchTeva Pharmaceutical IndustriesNovartis
Mots-clésAsthmaCOPDMedicineAtopyImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Some people have characteristics of both asthma and COPD (asthma-COPD overlap), and evidence suggests they experience worse outcomes than those with either condition alone. RESEARCH QUESTION: What is the genetic architecture of asthma-COPD overlap, and do the determinants of risk for asthma-COPD overlap differ from those for COPD or asthma? STUDY DESIGN AND METHODS: ) that remained associated in analyses comparing (1) asthma-COPD overlap vs asthma-only control subjects, and (2) asthma-COPD overlap vs COPD-only control subjects. These variants were analyzed in 12 independent cohorts (stage 2). RESULTS: ) for asthma-COPD overlap (meta-analysis of stage 1 and 2 studies). These signals suggest a spectrum of shared genetic influences, some predominantly influencing asthma (FAM105A, GLB1, PHB, TSLP), others predominantly influencing fixed airflow obstruction (IL17RD, C5orf56, HLA-DQB1). One intergenic signal on chromosome 5 had not been previously associated with asthma, COPD, or lung function. Subgroup analyses suggested that associations at these eight signals were not driven by smoking or age at asthma diagnosis, and in phenome-wide scans, eosinophil counts, atopy, and asthma traits were prominent. INTERPRETATION: We identified eight signals for asthma-COPD overlap, which may represent loci that predispose to type 2 inflammation, and serious long-term consequences of asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,738

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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