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Enregistrement W4220692319 · doi:10.1016/j.inpa.2022.03.004

Fusion of spatiotemporal and thematic features of textual data for animal disease surveillance

2022· article· en· W4220692319 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInformation Processing in Agriculture · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundRégion Occitanie Pyrénées-MéditerranéeCentre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le DéveloppementAgence Nationale de la RechercheEuropean Commission
Mots-clésContext (archaeology)Computer scienceRepresentation (politics)Information retrievalSelection (genetic algorithm)Feature selectionDisease surveillanceFeature (linguistics)Sensor fusionData miningArtificial intelligenceNatural language processingDiseaseGeographyMedicinePathologyLinguistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several internet-based surveillance systems have been created to monitor the web for animal health surveillance. These systems collect a large amount of news dealing with outbreaks related to animal diseases. Automatically identifying news articles that describe the same outbreak event is a key step to quickly detect relevant epidemiological information while alleviating manual curation of news content. This paper addresses the task of retrieving news articles that are related in epidemiological terms. We tackle this issue using text mining and feature fusion methods. The main objective of this paper is to identify a textual representation in which two articles that share the same epidemiological content are close. We compared two types of representations (i.e., features) to represent the documents: (i) morphosyntactic features (i.e., selection and transformation of all terms from the news, based on classical textual processing steps) and (ii) lexicosemantic features (i.e., selection, transformation and fusion of epidemiological terms including diseases, hosts, locations and dates). We compared two types of term weighing (i.e., Boolean and TF-IDF) for both representations. To combine and transform lexicosemantic features, we compared two data fusion techniques (i.e., early fusion and late fusion) and the effect of features generalisation, while evaluating the relative importance of each type of feature. We conducted our analysis using a corpus composed of a subset of news articles in English related to animal disease outbreaks. Our results showed that the combination of relevant lexicosemantic (epidemiological) features using fusion methods improves classical morphosyntactic representation in the context of disease-related news retrieval. The lexicosemantic representation based on TF-IDF and feature generalisation (F-measure = 0.92, r-precision = 0.58) outperformed the morphosyntactic representation (F-measure = 0.89, r-precision = 0.45), while reducing the features space. Converting the features into lower granular features (i.e., generalisation) contributed to improving the results of the lexicosemantic representation. Our results showed no difference between the early and late fusion approaches. Temporal features performed poorly on their own. Conversely, spatial features were the most discriminative features, highlighting the need for robust methods for spatial entity extraction, disambiguation and representation in internet-based surveillance systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,407
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle