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Enregistrement W4220711770 · doi:10.1089/thy.2021.0542

Clinical Application of Next-Generation Sequencing in Advanced Thyroid Cancers

2022· article· en· W4220711770 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueThyroid · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoPublic Health OntarioPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMedullary thyroid cancerThyroid cancerAnaplastic thyroid cancerNeuroblastoma RAS viral oncogene homologPapillary thyroid cancerOncologyInternal medicineCancerThyroidClinical trialBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: With the emergence of mutation-based systemic therapies for patients with advanced thyroid cancer, molecular profiling has become an important component of care. Although next-generation sequencing (NGS) gene panels are accessible to clinicians, there is no consensus on the optimal approach to testing. This study investigates the clinical application of NGS results in the management of advanced thyroid cancer. Methods: Patients with advanced thyroid cancer with NGS completed as part of the Integrated Molecular Profiling in Advanced Cancers Trial (IMPACT; NCT01505400) or Ontario-wide Cancer TArgeted Nucleic Acid Evaluation (OCTANE; NCT02906943) clinical trials at the Princess Margaret Cancer Centre were included. Electronic medical records were reviewed to collect clinicopathologic and treatment data. The OncoKB framework was used to categorize molecular alterations based on levels of actionability. Patients with an actionable alteration by OncoKB framework who had treatment with a drug targeting the alteration were categorized as receiving “matched” therapy. Time-to-event data were analyzed using the Kaplan–Meier method. This study was approved by the University Health Network Research Ethics Board (ID# 19-5888). Results: NGS was performed on 118 patients with advanced thyroid cancer between 2013 and 2020. The most common molecular alterations included BRAF V600E (62%) and NRAS (15%) mutations in papillary thyroid cancer, RET alterations (78%) in medullary thyroid cancer, and BRAF V600E (38%) and TP53 (62%) mutations in anaplastic thyroid cancer. Actionable alterations were found in 87% of patients, and 57% of patients had at least one Level 1 or 2 alteration for which Food and Drug Administration (FDA)-approved drug is available. BRAF and RET alterations made up 86% of Level 1 and 2 alterations. A matched therapeutic approach was undertaken in 13% of patients. Conclusion: This study uses a structured framework to analyze the actionability and clinical use of NGS results in advanced thyroid cancer. Most patients had at least one potentially actionable mutation and 57% of patients had at least one Level 1 or 2 alteration, predominantly driven by BRAF V600E and RET alterations. This study rationalizes the need for routine multigene NGS testing or reflex BRAF and RET testing in the management of patients with advanced thyroid cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle