Genotype–phenotype correlations in <scp>CPT1A</scp> deficiency detected by newborn screening in Pacific populations
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Carnitine palmitoyltransferase 1A (CPT1A) deficiency is a long chain fatty acid oxidation disorder, typically presenting with hypoketotic hypoglycaemia and liver dysfunction during fasting and intercurrent illness. Classical CPT1A deficiency is a rare disease, although a milder ‘Arctic variant' (p.P479L) is common in the Inuit population. Since the introduction of expanded metabolic screening (EMS), the newborn screening programmes of Hawai'i and New Zealand (NZ) have detected a significant increase in the incidence of CPT1A deficiency. We report 22 individuals of Micronesian descent (12 in NZ and 10 in Hawai'i), homozygous for a CPT1A c.100T>C (p.S34P) variant detected by EMS or ascertained following diagnosis of a family member. No individuals with the Micronesian variant presented clinically with metabolic decompensation prior to diagnosis or during follow‐up. Three asymptomatic homozygous adults were detected following the diagnosis of their children by EMS. CPT1A activity in cultured skin fibroblasts showed residual enzyme activity of 26% of normal controls. Secondly, we report three individuals from two unrelated Niuean families who presented clinically with symptoms of classic CPT1A deficiency, prior to the introduction of EMS. All were found to be homozygous for a CPT1A c.2122A>C (p.S708R) variant. CPT1A activity in fibroblasts of all three individuals was severely reduced at 4% of normal controls. Migration pressure, in part due to climate change may lead to increased frequency of presentation of Pacific peoples to regional metabolic services around the world. Knowledge of genotype–phenotype correlations in these populations will therefore inform counselling and treatment of those detected by newborn screening.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».