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Enregistrement W4220716783 · doi:10.1002/ajmg.a.62729

Novel <scp>FGF9</scp> variant contributes to multiple synostoses syndrome 3

2022· article· en· W4220716783 sur OpenAlexaff
Stephanie M. Dobson, Courtney Kiss, Daniel Borschneck, Karen E. Heath, Adrian Gross, Marc Glucksman, Andrea Guerin

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynostosisFGF9BrachydactylyBiologyGeneticsPhenotypeExome sequencingDysostosisGenetic heterogeneityAnatomyMedicineGeneShort statureInternal medicineEndocrinologyCongenital disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple synostoses syndromes (SYNS) are autosomal dominant syndromes characterized by multiple joint fusions commonly involving the carpal-tarsal, interphalangeal, humeroradial, and cervical spine joints. They display genetic heterogeneity with pathogenic variants reported in four separate genes (NOG, GDF5, FGF9, and GDF6) defining four different SYNS forms. FGF9 variants have been reported in SYNS3, a SYNS with multiple synostoses, normal cognition, normal hearing, and craniosynostosis. Here, we report a novel FGF9 c.569G > C p.(Arg190Thr) variant identified by whole-exome sequencing in a patient with multiple bony abnormalities. The patient initially presented with elbow instability and decreased range of motion. Imaging revealed bilateral radial head deformities, carpal-tarsal fusions, brachydactyly, and osteoarthritis of the sacroiliac joints. In silico protein modeling of the identified FGF9 variant predicts decreased stability of ligand-receptor binding supporting the pathogenicity of this finding. This finding expands the repertoire of FGF9 variants and phenotypic information reported for SYNS3 and suggest that genotype phenotype correlations due to localization seem less likely and more so due to the consequence of the pathogenic variant on the receptor. This is useful in the counseling in families as more de novo variants emerge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,844
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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