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Enregistrement W4220724837 · doi:10.3390/molecules27072251

Coated Blade Spray-Mass Spectrometry as a New Approach for the Rapid Characterization of Brain Tumors

2022· article· en· W4220724837 sur OpenAlexaff
Joanna Bogusiewicz, Magdalena Gaca-Tabaszewska, Dominik Olszówka, Karol Jaroch, Jacek Furtak, Marek Harat, Janusz Pawliszyn, Barbara Bojko

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNarodowe Centrum Nauki
Mots-clésMass spectrometryChromatographyAnalyteChemistryMetaboliteMass spectrometry imagingQuantitative analysis (chemistry)ReproducibilityMetabolomicsAnalytical Chemistry (journal)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain tumors are neoplasms with one of the highest mortality rates. Therefore, the availability of methods that allow for the quick and effective diagnosis of brain tumors and selection of appropriate treatments is of critical importance for patient outcomes. In this study, coated blade spray-mass spectrometry (CBS-MS), which combines the features of microextraction and fast ionization methods, was applied for the analysis of brain tumors. In this approach, a sword-shaped probe is coated with a sorptive material to enable the extraction of analytes from biological samples. The analytes are then desorbed using only a few microliters of solvent, followed by the insertion of the CBS device into the interface on the mass spectrometer source. The results of this proof-of-concept experiment confirmed that CBS coupled to high-resolution mass spectrometry (HRMS) enables the rapid differentiation of two histologically different lesions: meningiomas and gliomas. Moreover, quantitative CBS-HRMS/MS analysis of carnitine, the endogenous compound, previously identified as a discriminating metabolite, showed good reproducibility with the variation below 10% when using a standard addition calibration strategy and deuterated internal standards for correction. The resultant data show that the proposed CBS-MS technique can be useful for on-site qualitative and quantitative assessments of brain tumor metabolite profiles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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