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Enregistrement W4220741343 · doi:10.1002/smtd.202101467

Cancer Stem Cell DNA Enabled Real‐Time Genotyping with Self‐Functionalized Quantum Superstructures—Overcoming the Barriers of Noninvasive cfDNA Cancer Diagnostics

2022· article· en· W4220741343 sur OpenAlexafffund
Rupa Haldavnekar, Swarna Ganesh, Krishnan Venkatakrishnan, Bo Tan

Notice bibliographique

RevueSmall Methods · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLiquid biopsyCancerPersonalized medicineComputational biologyDNAMedicineOncologyCancer researchBioinformaticsInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cancer diagnosis and determining its tissue of origin are crucial for clinical implementation of personalized medicine. Conventional diagnostic techniques such as imaging and tissue biopsy are unable to capture the dynamic tumor landscape. Although circulating tumor DNA (ctDNA) shows promise for diagnosis, the clinical relevance of ctDNA remains largely undetermined due to several biological and technical complexities. Here, cancer stem cell‐ctDNA is used to overcome the biological complexities like the inability for molecular analysis of ctDNA and dependence on ctDNA concentration rather than the molecular profile. Ultrasensitive quantum superstructures overcome the technical complexities of trace‐level detection and rapid diagnosis to detect ctDNA within its short half‐life. Activation of multiple surface enhanced Raman scattering mechanisms of the quantum superstructures achieved a very high enhancement factor (1.35 × 1011) and detection at ultralow concentration (10−15M) with very high reliability (RSD: 3–12%). Pilot validation with clinical plasma samples from an independent validation cohort achieved a diagnosis sensitivity of ≈95% and specificity of 83%. Quantum superstructures identified the tissue of origin with ≈75–86% sensitivity and ≈92–96% specificity. With large scale clinical validation, the technology can develop into a clinically useful liquid biopsy tool improving cancer diagnostics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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