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Enregistrement W4220757474 · doi:10.1038/s41467-022-28905-5

Autoantibodies targeting GPCRs and RAS-related molecules associate with COVID-19 severity

2022· article· en· W4220757474 sur OpenAlexafffund
Otávio Cabral-Marques, Gilad Halpert, Lena F. Schimke, Yuri Ostrinski, Aristo Vojdani, G. Baiocchi, Paula Paccielli Freire, Igor Salerno Filgueiras, Israel Zyskind, Miriam T. Lattin, Florian Tran, Stefan Schreiber, Alexandre H. C. Marques, Desirée Rodrigues Plaça, Dennyson Leandro M. Fonseca, Jens Y. Humrich, Antje Müller, Lasse M. Giil, Hanna Graßhoff, Anja Schümann, Alexander Hackel, Juliane Junker, Carlotta Meyer, Hans D. Ochs, Yael Lavi, Carmen Scheibenbogen, Ralf Dechend, Igor Jurišica, Kai Schulze‐Forster, Jonathan I. Silverberg, Howard Amital, Jason Zimmerman, Harry Heidecke, Avi Z. Rosenberg, Gabriela Riemekasten, Yehuda Shoenfeld

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensArthritis Research Centre of CanadaDiscovery CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesIsrael Science FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésAutoantibodyImmunologyAntibodyDiseaseImmune systemPathogenesisChemokine receptorCXCR3ReceptorMedicineBiologyChemokineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

COVID-19 shares the feature of autoantibody production with systemic autoimmune diseases. In order to understand the role of these immune globulins in the pathogenesis of the disease, it is important to explore the autoantibody spectra. Here we show, by a cross-sectional study of 246 individuals, that autoantibodies targeting G protein-coupled receptors (GPCR) and RAS-related molecules associate with the clinical severity of COVID-19. Patients with moderate and severe disease are characterized by higher autoantibody levels than healthy controls and those with mild COVID-19 disease. Among the anti-GPCR autoantibodies, machine learning classification identifies the chemokine receptor CXCR3 and the RAS-related molecule AGTR1 as targets for antibodies with the strongest association to disease severity. Besides antibody levels, autoantibody network signatures are also changing in patients with intermediate or high disease severity. Although our current and previous studies identify anti-GPCR antibodies as natural components of human biology, their production is deregulated in COVID-19 and their level and pattern alterations might predict COVID-19 disease severity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations147
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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