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Enregistrement W4220758647 · doi:10.1186/s42483-022-00112-6

A virus-derived small RNA targets the rice transcription factor ROC1 to induce disease-like symptom

2022· article· en· W4220758647 sur OpenAlexfundno aff
Xiuqin Huang, Feifei Li, Xishan Zhang, Jiahao Chen, Junkai Wang, Wei Jing, Xin Yang, Guohui Zhou, Tong Zhang

Notice bibliographique

RevuePhytopathology Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFok Ying Tung Education FoundationInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesPostdoctoral Research Foundation of ChinaInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyVirusVirologyPhenotypeTranscription factorDownregulation and upregulationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Virus-derived small interfering RNAs (vsiRNAs) in plants can target host transcripts to induce symptom development. Southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV) is the most damaging rice-infecting virus, which causes severe stunting and poorly developed roots in rice plants, thereby posing a serious threat to rice production. In this study, we show that a vsiRNA (vsiR-S9-18), generated from SRBSDV genome segment 9, targets the transcription factor ROC1 in rice. SRBSDV infection triggered the production of vsiR-S9-18 and resulted in the downregulation of ROC1 in rice plants. Transient expression of vsiR-S9-18 in rice protoplasts and tobacco leaves further demonstrated the specific association of vsiR-S9-18 with ROC1 . Moreover, the ROC1 -knockout rice plants displayed shortened roots, similar to the phenotype of root growth inhibition caused by SRBSDV infection. We propose that vsiR-S9-18 inhibits root elongation via ROC1 , which has been proven to regulate root growth. This finding extends our understanding of the role of vsiRNA in viral disease development and is helpful for the development of new antiviral approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,962
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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