Variants in Interferon Lambda are Associated with Very Early Onset Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Inflammatory bowel diseases (IBD) are chronic inflammatory disorders of the intestine that affect children and adults. The etiology is multifactorial with the contribution of genetic, immune, microbial, and environmental risk factors with a substantial involvement of host:microbial cross-talk in the lumen. Whether and how antiviral responses contribute to IBD pathogenesis is under intense investigation. Here, we identified two unrelated patients diagnosed with very early onset IBD (VEOIBD) with rare variants in type III Interferons (IFNs), also known as interferon lambdas (IFNλs), a group of IFNs that play key roles in the protection against enteric viruses. The first patient was found to have homozygous variants in both IFNL2 and IFNL3 , the genes encoding, IFN-λ2 and IFN-λ3, respectively. The second patient was found to have inherited compound heterozygous variants in IFNL3 , with one of the two alleles bearing the same variant as the first patient. Functional analyses revealed that the proteins coded for by these variant IFN-λ genes exhibited defects in the induction of IFN signaling. More detailed assessment of the variants identified in Patient 1 demonstrated defects in their ability to bind to IFN-λ receptor 1 (IFNLR1), as well as their ability to induce heterodimerization of IFNLR1 and IL10RB, which together compromise the functional receptor for IFN-λ (IFNLR). These patient-encoded IFN-λ variants also exhibit defects in the ability to induce robust downstream IFN-stimulated genes (ISGs) in patient-derived intestinal organoids. All in all, we demonstrate that VEOIBD is associated with variants in IFN-λs and defective induction of downstream IFN signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».