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Enregistrement W4220815872 · doi:10.1101/2022.03.08.22272080

Exposures associated with sporadic <i>Cryptosporidium</i> infection in industrialised countries: a systematic review

2022· review· en· W4220815872 sur OpenAlexaboutno aff
Caoimhe McKerr, Wendi Shepherd, Rachel M. Chalmers, Roberto Vivancos, S. O’Brien, Alison Waldram, Kevin Pollock, Robert Christley

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of LiverpoolPublic Health EnglandUniversity of East AngliaNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of OxfordPublic Health Wales
Mots-clésGrey literatureCryptosporidiumScopusPsychological interventionSystematic reviewEnvironmental healthMedicineOutbreakGeographyMEDLINEFamily medicinePathologyBiologyEcologyFecesPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Transmission of Cryptosporidium can occur via contaminated food or water, contact with animals or other people. Exposures are often identified from outbreak investigations, but sources for sporadic disease and pathways to infection are still unclear. The aim of this review is to consolidate the literature to describe exposures associated with human cryptosporidiosis in industrialised countries. Methods followed the recommendations made in the Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions. Three steps were used to identify the literature including electronic database searching using PubMed, Scopus and Web Of Science; reference list trawling; and an exploration of the grey literature. Quality was assessed using the Newcastle-Ottawa Scale. Screening of results was undertaken by two reviewers and data extracted using a standardised form. A narrative summary presented. Papers were included if they reported on sporadic cases and were published between 2008 and 2018. Exposures were grouped into pathways. After full-text screening, eight articles (comprising 11 studies) were included, and seven (comprising 10 studies) were suitable for further synthesis. None of the identified grey literature was included. Four studies described case-control methods, two were case-case studies and one cross-sectional. Study year ranged from 1999 to 2017 and the studies were conducted in five, large countries in three continents: Europe (UK and the Netherlands), North America (USA, Canada), and Australia. Included papers investigated water and animal exposures most frequently. Recreational water was not a major source of sporadic illness in this review. The person-to-person pathway represented the most consistent finding, with all three studies reporting on contact with a symptomatic individual demonstrating correlations between exposure and disease. This applied particularly to the home environment, which is increasingly understood to be a significant setting for spread of Cryptosporidium infection. Further work on this would help support public health messaging on preventing spread of disease at home. Systematic review registration: PROSPERO number CRD42017056589.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,032
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,032
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,006
Bibliométrie0,0100,012
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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