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Enregistrement W4220818334 · doi:10.1007/s00122-021-03980-2

Main effect and epistatic QTL affecting spike shattering and association with plant height revealed in two spring wheat (Triticum aestivum L.) populations

2022· article· en· W4220818334 sur OpenAlexafffund
Firdissa E. Bokore, Richard D. Cuthbert, R. E. Knox, Heather Campbell, Brad Meyer, Amidou N’Diaye, Curtis Pozniak, R. M. DePauw

Notice bibliographique

RevueTheoretical and Applied Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesSaskatchewan Wheat Development CommissionGenome CanadaAlberta Wheat CommissionGrain Farmers of OntarioDuPont PioneerWestern Grains Research Foundation
Mots-clésQuantitative trait locusEpistasisBiologyPopulationCommon wheatChromosomeInclusive composite interval mappingGeneticsAgronomyGene mappingGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

KEY MESSAGE: A major QTL on chromosome arm 4BS was associated with reduced spike shattering and reduced plant height in coupling phase, and a second major QTL associated with reduced spike shattering was detected on chromosome arm 5AL in the same wheat variety Carberry. Spike shattering can cause severe grain yield loss in wheat. Development of cultivars with reduced shattering but having easy mechanical threshability is the target of wheat breeding programs. This study was conducted to determine quantitative trait loci (QTL) associated with shattering resistance, and epistasis among QTL in the populations Carberry/AC Cadillac and Carberry/Thatcher. Response of the populations to spike shattering was evaluated near Swift Current, SK, in four to five environments. Plant height data recorded in different locations and years were used to determine the relationship of the trait with spike shattering. Each population was genotyped and mapped with the wheat 90 K Illumina iSelect SNP array. Main effect QTL were analyzed by MapQTL 6, and epistatic interactions between main effect QTL were determined by QTLNetwork 2.0. Correlations between height and shattering ranged from 0.15 to 0.49. Carberry contributed two major QTL associated with spike shattering on chromosome arms 4BS and 5AL, detected in both populations. Carberry also contributed two minor QTL on 7AS and 7AL. AC Cadillac contributed five minor QTL on 1AL, 2DL, 3AL, 3DL and 7DS. Nine epistatic QTL interactions were identified, out of which the most consistent and synergistic interaction, that reduced the expression of shattering, occurred between 4BS and 5AL QTL. The 4BS QTL was consistently associated with reduced shattering and reduced plant height in the coupling phase. The present findings shed light on the inheritance of shattering resistance and provide genetic markers for manipulating the trait to develop wheat cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,349
Score d'incertitude au seuil0,275

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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