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Enregistrement W4220819540 · doi:10.1002/csc2.20741

QTL mapping for adult plant field resistance to stripe rust in the AAC Cameron/P2711 spring wheat population

2022· article· en· W4220819540 sur OpenAlexaffabout
Momna Farzand, Raman Dhariwal, Colin W. Hiebert, Dean Spaner, Harpinder Randhawa

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusPopulationMarker-assisted selectionPlant geneticsCultivarAgronomySingle-nucleotide polymorphismPlant disease resistanceRust (programming language)GenotypeGeneticsHorticultureGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Stripe rust, caused by Puccinia striiformis f. sp . tritici ( Pst ), is a devastating disease of wheat ( Triticum aestivum L.). Deployment of resistant wheat cultivars is one of the best strategies to mitigate disease‐associated risks. The genotype P2711 possesses effective stripe rust resistance under field conditions in western Canada, however, the genetic basis of this resistance is unknown. To identify resistance, a recombinant inbred line (RIL) population comprised of 252 RILs was developed from the cross AAC Cameron/P2711. This population was evaluated for stripe rust severity at the adult plant stage in Creston, BC (in 2018, 2019, and 2020) and Lethbridge, AB (in 2018 and 2020), and was genotyped using the wheat 90K iSelect single nucleotide polymorphism (SNP) assay. A high‐density genetic map comprised of 8,915 markers was constructed covering all the wheat chromosomes. Four resistance quantitative trait loci (QTLs) were contributed by P2711 and three from AAC Cameron. QYr.lrdc‐2A.1 , corresponding to the Yr17 gene, was the most stable QTL and detected in four out of five environments, whereas QYr.lrdc‐2B was the second most stable QTL. These two QTL along with QYr.lrdc‐5A showed a significant reduction in stripe rust severity when present together. Where most of the QTLs detected in both locations, QYr.lrdc‐1A.1 and QYr.lrdc‐1A.2 , both were detected only in Creston, BC. Stable QTLs on chromosome 2A, 2B, and 5A, and their closely associated markers identified in this study could be utilized in marker‐assisted selection for stripe rust resistant cultivar development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,891
Score d'incertitude au seuil0,625

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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