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Enregistrement W4220848529 · doi:10.1073/pnas.2111404119

A DNA repair-independent role for alkyladenine DNA glycosylase in alkylation-induced unfolded protein response

2022· article· en· W4220848529 sur OpenAlexaff
Larissa Milano, Clara Forrer Charlier, Rafaela Rafognatto Andreguetti, Thomas C. Cox, Eleanor Healing, Marcos Paulo Machado Thomé, Ruan Elliott, Leona D. Samson, Jean‐Yves Masson, Guido Lenz, João Antônio Pêgas Henriques, Axel Nohturfft, Lisiane B. Meira

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoNational Institute of Environmental Health SciencesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoRoyal Society
Mots-clésUnfolded protein responseXBP1DNA glycosylaseDNA damageDNA repairMethyl methanesulfonateDNAEndoplasmic reticulumCellular stress responseBiologyChemistryGeneCell biologyBiochemistryFight-or-flight responseMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Stress response pathways, such as the DNA damage response and the UPR, are critical in the etiology and treatment of cancer and other chronic diseases. Knowledge of an interplay between ER stress and genome damage repair is emerging, but evidence linking defective DNA repair and impaired ER stress response is lacking. Here, we show that AAG is necessary for UPR activation in response to alkylating agents. AAG-deficient mice and human cancer cells are impaired in alkylation-induced UPR. Strikingly, this defect can be complemented by an AAG variant defective in glycosylase activity. Our studies suggest that AAG has noncanonical functions and identify AAG as a point of convergence for stress response pathways. This knowledge could be explored to improve cancer treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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