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Enregistrement W4220855574 · doi:10.1080/19490976.2022.2050636

Roux-en-Y gastric bypass and sleeve gastrectomy induce substantial and persistent changes in microbial communities and metabolic pathways

2022· article· en· W4220855574 sur OpenAlexafffund
Jerry T. Dang, Valentin Mocanu, Heekuk Park, Michael Laffin, Naomi Hotte, Shahzeer Karmali, Daniel W. Birch, Karen Madsen

Notice bibliographique

RevueGut Microbes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésWeight lossMetabolomicsFirmicutesSleeve gastrectomyBiologyGut floraInsulin resistanceMetabolic syndromeProteobacteriaPhysiologyGastric bypassInternal medicineGastroenterologyObesityBioinformaticsEndocrinologyMedicineBacteriaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bariatric surgery induces significant microbial and metabolomic changes, however, links between microbial and metabolic pathways have not been fully elucidated. The objective of this study was to conduct a comprehensive investigation of the microbial, metabolomic, and inflammatory changes that occur following Roux-en-Y gastric bypass (RYGB) and sleeve gastrectomy (SG). A prospective clinical trial was conducted with participants undergoing RYGB, SG, and non-operative controls (CTRL). Clinical parameters, blood samples, and fecal samples were collected pre-intervention and at 3 and 9 months. A multi-omics approach was used to perform integrated microbial-metabolomic analysis to identify functional pathways in which weight loss and metabolic changes occur after surgery. RYGB led to profound microbial changes over time that included reductions in alpha-diversity, increased Proteobacteria and Verrucomicrobiota, decreased Firmicutes, and numerous changes at the genera level. These changes were associated with a reduction in inflammation and significant weight loss. A reduction in Romboutsia genera correlated strongly with weight loss and integrated microbial-metabolomic analysis revealed the importance of Romboutsia. Its obliteration correlated with improved weight loss and insulin resistance, possibly through decreases in glycerophospholipids. In contrast, SG was associated with no changes in alpha-diversity, and only a small number of changes in microbial genera. A cluster of Firmicutes genera including Butyriciccocus, Eubacterium ventriosum, and Monoglobus was decreased, which correlated with decreased weight, insulin resistance, and systemic inflammation. This work represents comprehensive analyses of microbial-metabolomic changes that occur following bariatric surgery and identifies several pathways that are associated with beneficial metabolic effects of surgery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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