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Enregistrement W4220862309 · doi:10.1186/s13071-022-05197-8

Species and genotypes belonging to Echinococcus granulosus sensu lato complex causing human cystic echinococcosis in Europe (2000–2021): a systematic review

2022· review· en· W4220862309 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeSapienza Università di RomaUniversität ZürichInstituut voor Tropische GeneeskundeEuropean CommissionUniversität HohenheimIstituto Superiore di SanitàHaridus- ja Teadusministeerium
Mots-clésEchinococcus granulosusSensuBiologyParasitologyCystic echinococcosisEchinococcosisGenotypeMedical microbiologyZoologyEchinococcusVeterinary medicineVirologyGeneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: This study aimed to fill a gap of knowledge by providing a quantitative measure of molecularly identified species and genotypes belonging to Echinococcus granulosus sensu lato (s.l.) causing human cystic echinococcosis (CE) in Europe during the period 2000-2021. As these species and genotypes are characterized by genetic, animal host and geographical differences, studying the E. granulosus s.l. complex is epidemiologically relevant. METHODS: A systematic review (SR) was conducted on the basis of both scientific and grey literature considering primary studies between 2000 and 2021 in four databases. From a total of 1643 scientific papers, 51 records were included in the SR. The main inclusion criterion for this study was the molecular confirmation of E. granulosus s.l. at the genotype/species level as a causative agent of human CE cases in selected European countries. RESULTS: Relevant data were obtained from 29 out of 39 eligible European countries. This SR identified 599 human molecularly confirmed echinococcal cysts: 460 (76.8%) identified as E. granulosus sensu stricto (s.s.), 130 (21.7%) as E. canadensis cluster (G6/7 and G10), 7 (1.2%) as E. ortleppi (G5), and 2 as E. vogeli (0.3%). Three geographical hotspots of human CE caused by different species of the E. granulosus s.l. complex were identified: (1) E. granulosus s.s. in Southern and South-eastern Europe (European-Mediterranean and Balkan countries); (2) E. canadensis (G6/7) in Central and Eastern Europe; (3) E. ortleppi in Central and Western Europe. This SR also identified data gaps that prevented a better definition of the geographical distribution of the Echinococcus granulosus s.l. species complex in Europe: western Balkan countries, part of Central Europe, and Baltic countries. CONCLUSIONS: These results mandate longitudinal, multi-centre, intersectoral and transdisciplinary studies which consider both molecular and clinical epidemiology in animals and humans. Such studies would be valuable for a better understanding of the transmission of the E. granulosus s.l. species complex and their potential clinical impact on humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle