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Enregistrement W4220880857 · doi:10.3389/fimmu.2022.829228

Deletion of the Natural Killer Cell Receptor NKG2C Encoding KLR2C Gene and Kidney Transplant Outcome

2022· article· en· W4220880857 sur OpenAlexaff
Hannes Vietzen, Bernd Döhler, Thuong Hien Tran, Caner Süsal, Philip F. Halloran, Farsad Eskandary, Carsten T. Herz, Katharina A. Mayer, Nicolas Kozakowski, Markus Wahrmann, Sarah Ely, Susanne Haindl, Elisabeth Puchhammer‐Stöckl, Georg A. Böhmig

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCohortAntibodyInterquartile rangeImmunologyContext (archaeology)ReceptorGenotypeKidney transplantationInternal medicineTransplantationGastroenterologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural killer (NK) cells may contribute to antibody-mediated rejection (ABMR) of renal allografts. The role of distinct NK cell subsets in this specific context, such as NK cells expressing the activating receptor NKG2C, is unknown. Our aim was to investigate whether KLRC2 gene deletion variants which determine NKG2C expression affect the pathogenicity of donor-specific antibodies (DSA) and, if so, influence long-term graft survival. We genotyped the KLRC2wt/del variants for two distinct kidney transplant cohorts, (i) a cross-sectional cohort of 86 recipients who, on the basis of a positive post-transplant DSA result, all underwent allograft biopsies, and (ii) 1,860 recipients of a deceased donor renal allograft randomly selected from the Collaborative Transplant Study (CTS) database. In the DSA+ patient cohort, KLRC2wt/wt (80%) was associated with antibody-mediated rejection (ABMR; 65% versus 29% among KLRC2wt/del subjects; P=0.012), microvascular inflammation [MVI; median g+ptc score: 2 (interquartile range: 0-4) versus 0 (0-1), P=0.002], a molecular classifier of ABMR [0.41 (0.14-0.72) versus 0.10 (0.07-0.27), P=0.001], and elevated NK cell-related transcripts (P=0.017). In combined analyses of KLRC2 variants and a functional polymorphism in the Fc gamma receptor IIIA gene (FCGR3A-V/F158), ABMR rates and activity gradually increased with the number of risk genotypes. In DSA+ and CTS cohorts, however, the KLRC2wt/wt variant did not impact long-term death-censored graft survival, also when combined with the FCGR3A-V158 risk variant. KLRC2wt/wt may be associated with DSA-triggered MVI and ABMR-associated gene expression patterns, but the findings observed in a highly selected cohort of DSA+ patients did not translate into meaningful graft survival differences in a large multicenter kidney transplant cohort not selected for HLA sensitization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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