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Enregistrement W4220908009 · doi:10.3390/molecules27061996

Discovery of a New Drug-like Series of OGT Inhibitors by Virtual Screening

2022· article· en· W4220908009 sur OpenAlexafffund
Elena M. Loi, Tihomir Tomašič, Cyril Balsollier, Kevin van Eekelen, Matjaž Weiss, Martina Gobec, Matthew G. Alteen, David J. Vocadlo, Roland J. Pieters, Marko Anderluh

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesJavna Agencija za Raziskovalno Dejavnost RSCanadian Institutes of Health ResearchEuropean Cooperation in Science and Technology
Mots-clésVirtual screeningDrug discoveryEnzymeComputational biologyTransferaseChemistryDrugBiochemistryPharmacologyCombinatorial chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

O-GlcNAcylation is an essential post-translational modification installed by the enzyme O-β-N-acetyl-d-glucosaminyl transferase (OGT). Modulating this enzyme would be extremely valuable to better understand its role in the development of serious human pathologies, such as diabetes and cancer. However, the limited availability of potent and selective inhibitors hinders the validation of this potential therapeutic target. To explore new chemotypes that target the active site of OGT, we performed virtual screening of a large library of commercially available compounds with drug-like properties. We purchased samples of the most promising virtual hits and used enzyme assays to identify authentic leads. Structure-activity relationships of the best identified OGT inhibitor were explored by generating a small library of derivatives. Our best hit displays a novel uridine mimetic scaffold and inhibited the recombinant enzyme with an IC50 value of 7 µM. The current hit represents an excellent starting point for designing and developing a new set of OGT inhibitors that may prove useful for exploring the biology of OGT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,399

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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