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Enregistrement W4220913055 · doi:10.1126/sciimmunol.abi5072

Spatially mapping the immune landscape of melanoma using imaging mass cytometry

2022· article· en· W4220913055 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScience Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontMcGill Genome CentreCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityMcGill University Health CentreJewish General HospitalMontreal General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMass cytometryTumor microenvironmentImmune systemStromal cellCytotoxic T cellMelanomaBiologyCancer researchCD8ImmunotherapyImmunologyImmune checkpointAntigenTumor-infiltrating lymphocytesPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melanoma is an immunogenic cancer with a high response rate to immune checkpoint inhibitors (ICIs). It harbors a high mutation burden compared with other cancers and, as a result, has abundant tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) within its microenvironment. However, understanding the complex interplay between the stroma, tumor cells, and distinct TIL subsets remains a substantial challenge in immune oncology. To properly study this interplay, quantifying spatial relationships of multiple cell types within the tumor microenvironment is crucial. To address this, we used cytometry time-of-flight (CyTOF) imaging mass cytometry (IMC) to simultaneously quantify the expression of 35 protein markers, characterizing the microenvironment of 5 benign nevi and 67 melanomas. We profiled more than 220,000 individual cells to identify melanoma, lymphocyte subsets, macrophage/monocyte, and stromal cell populations, allowing for in-depth spatial quantification of the melanoma microenvironment. We found that within pretreatment melanomas, the abundance of proliferating antigen-experienced cytotoxic T cells (CD8 + CD45RO + Ki67 + ) and the proximity of antigen-experienced cytotoxic T cells to melanoma cells were associated with positive response to ICIs. Our study highlights the potential of multiplexed single-cell technology to quantify spatial cell-cell interactions within the tumor microenvironment to understand immune therapy responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle