Hypersensitive response-like cell death and its key related genes in the <i>lmd</i> lesion mimic mutant of birch
Notice bibliographique
Résumé
Lesion mimic mutants (LMMs) often display hypersensitive response-like (HR-like) cell death and enhanced resistance to pathogens. LMMs have been viewed as useful for the study of the mechanism of cell death and plant immunity. To date, few LMMs have been found in woody plants. We previously identified an LMM termed lmd, which showed spontaneous cell death in birch. In the current study, we investigated lmd, oe21 (transgenic control), and NT (nontransgenic control), focusing on cell death and gene expression profile of lmd. We found that cell death in the lmd occurred gradually during leaf development. The number of necrotic spots increased as the leaf developed, with no significant change in spot size. Subcellular observations showed degradation of both mitochondria and chloroplasts in lmd cells but not in NT and oe21 cells. Autophagosomes were visible in dying cells of lmd. We then performed RNA-seq of the four most apical leaves of lmd and oe21 to explore the gene expression profile during cell death. Genes that were functional in signal perception, respiratory burst, signal transduction, and defense were enriched. TGA1, WRKY33, WRKY40, Chitinase, FLS2, RbohA/D, and SBT were identified as key genes involved in cell death in lmd.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».