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Enregistrement W4220939251 · doi:10.12688/openreseurope.14344.1

Human papillomavirus (HPV) detection in vaginal self-samples: evaluation of eNat® as an alternative suspension medium to ThinPrep®PreservCyt® for vaginal swabs

2022· article· en· W4220939251 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOpen Research Europe · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeEuropean Commission
Mots-clésColposcopyMedicineHybrid captureCervical cancerGynecologyHuman papillomavirusObstetricsCervical intraepithelial neoplasiaCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p>Human Papillomavirus (HPV) testing on self-collected samples allows for improved coverage rates of cervical cancer (CC) screening programs. ThinPrep®PreservCyt® (HOLOGIC®, USA) medium is widely used for the suspension of cervical and vaginal self-samples. However, this medium is costly, toxic, and flammable, involving special handling procedures which make its use difficult in screening programs, particularly in low- and middle-income countries.</ns4:p> <ns4:p> This pilot study aimed to evaluate the analytical performance of eNat <ns4:bold>®</ns4:bold> (Copan SpA), an alternative non-alcohol-based suspension medium, compared to ThinPrep®PreservCyt® (HOLOGIC®) for high-risk HPV (hrHPV) detection in vaginal self-collected swabs using three different real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) HPV assays: Anyplex™II HPV28 (Seegene, Korea), Papilloplex® High Risk HPV (GeneFirst, UK), and HPV OncoPredict (Hiantis, Italy). </ns4:p> <ns4:p>30 women, referred to colposcopy, were enrolled in this observational, prospective pilot study and asked to collect two vaginal self-taken samples, which were suspended in 5 mL of ThinPrep®PreservCyt® or eNat®. Nucleic acids were extracted from 200 μL using Microlab Nimbus platform (Seegene, Korea) and tested with the three different RT-PCR full-genotyping high-risk HPV assays. The HPV results of vaginal samples resuspended in the two different media were compared to those obtained from the reference clinician-collected cervical sample from the same woman.</ns4:p> <ns4:p> hrHPV detection in vaginal self-samples suspended in both media demonstrated a substantial agreement with cervical samples with the three assays under-investigation (0.667 <ns4:underline>&lt;</ns4:underline> k <ns4:underline>&lt;</ns4:underline> 0.796). Moreover, the discordances between vaginal self-samples collected from the same woman were found only in cases of normal cytology or low-grade cytological lesions and were generally related to low hrHPV viral loads as indicated by the quantitative HPV OncoPredict assay (6.24E+02 copies/10,000 cells). </ns4:p> <ns4:p>This study demonstrated a very good agreement between cervical and vaginal self-collected samples suspended in ThinPrep®PreservCyt® and eNat®, suggesting that the latter could represent a good alternative medium in HPV screening programs based on self-collection.</ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,454
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,269
Tête enseignante GPT0,512
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle