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Enregistrement W4220963521 · doi:10.1007/s12275-022-1603-4

Integrated proteomic and metabolomic analyses reveal significant changes in chloroplasts and mitochondria of pepper (Capsicum annuum L.) during Sclerotium rolfsii infection

2022· article· en· W4220963521 sur OpenAlexaff
Hongdong Liao, Xiangyu Wen, Xuelei Deng, Yonghong Wu, Jianping Xu, Xin Li, Shudong Zhou, Xuefeng Li, Chunhui Zhu, Feng Luo, Yanqing Ma, Jingyuan Zheng

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSclerotiumPepperBiologyProteomeMetabolomeCarotenoidMetabolomicsBotanyChloroplastChlorophyllPlant physiologyBiochemistryHorticultureBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infection by Sclerotium rolfsii will cause serious disease and lead to significant economic losses in chili pepper. In this study, the response of pepper during S. rolfsii infection was explored by electron microscopy, physiological determination and integrated proteome and metabolome analyses. Our results showed that the stomata of pepper stems were important portals for S. rolfsii infection. The plant cell morphology was significantly changed at the time of the fungal hyphae just contacting (T1) or surrounding (T2) the pepper. The chlorophyll, carotenoid, and MDA contents and the activities of POD, SOD, and CAT were markedly upregulated at T1 and T2. Approximately 4129 proteins and 823 metabolites were clearly identified in proteome and metabolome analyses, respectively. A change in 396 proteins and 54 metabolites in pepper stem tissues was observed at T1 compared with 438 proteins and 53 metabolites at T2. The proteins and metabolites related to photosynthesis and antioxidant systems in chloroplasts and mitochondria were disproportionally affected by S. rolfsii infection, impacting carbohydrate and amino acid metabolism. This study provided new insights into the response mechanism in pepper stems during S. rolfsii infection, which can guide future work on fungal disease resistance breeding in pepper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,450
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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