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Enregistrement W4220975180 · doi:10.5194/egusphere-egu22-5896

Exploring the Bacterial Preference for Terrestrial or Marine Organic Matter in Estuarine Sediments Using Compound Specific Stable Carbon Isotope Ratios: A Degradation Kinetics Study 

2022· preprint· en· W4220975180 sur OpenAlexaff
Yeganeh Mirzaei, Yves Gélinas

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganic matterHeterotrophEnvironmental chemistryEstuaryStable isotope ratioIsotopes of carbonChemistryTotal organic carbonBiologyEcologyBacteriaOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Preserving the health of estuarine ecosystems has been an increasing challenge in the recent past with the spreading of areas affected by deep-water hypoxic conditions. Hence, it is of critical importance to identify the causes of such perturbation, triggered by changing ocean circulation and increasing inputs of organic matter (OM), which results in serious threats to living species. Estuaries are large deposition centers for organic matter (OM) where stable carbon isotope ratios of either bulk OM or specific organic compounds provide detailed information about carbon cycling and the tracing of OM sources and transformations along the terrestrial-marine continuum. In particular, the ∂13C values of biomarkers that are specific to heterotrophic bacteria (branched iso- and anteiso-C15:0 fatty acids) can be used to assess the type of OM that they preferentially degrade as the ∂13C values of marine organic carbon (OC) are more enriched in 13C than those of terrestrial OC. However, very little is known on the dynamics between the seasonally varying relative inputs of terrestrial vs. marine OM and the ∂13C values of these bacteria-specific fatty acids. In this study, we will use a kinetic batch incubation approach in which natural sediments from the St. Lawrence Estuary and Gulf, amended with fresh terrestrial or marine OM characterized by a very different 13C/12C ratio (difference of between 10 and 14 ‰ depending on the sampling station), will be incubated for varying amounts of time. Quenching of the incubations followed by the extraction, quantification and isotopic characterization of the bacterial fatty acids will allow determining the rate and temporal extent of change of their compound-specific ∂13C values. Bulk elemental (OC and total nitrogen) and isotopic (∂13C and ∂15N) mass balances will be precisely monitored throughout the experiment. Acquisition of this knowledge, combined with results from other studies carried out in our lab, will provide a better understanding of the relative importance of terrestrial and marine OM processing in the onset of hypoxia and will be exploited as a guide for remedial efforts aiming to improve the health of such an important ecosystem.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,184
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,079 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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